火龙果同其他仙人掌类植物一样，生长量比常规果树要小。所以施肥要以充足、少量、多次为原则。幼树(1～2年生)以施氮肥为主，做到薄施勤施，促进树体生长。成龄树(3年生以上)以施磷、钾肥为主，控制氮肥的施用量。      施肥应在春季新梢萌发期和果实膨大期进行，肥料一般以枯饼渣、鸡粪、猪粪按1：2：7配方，每年每株施有机肥25千克。或在每年7月、10月和翌年3月，每株各施牛粪堆肥1.2千克、复合肥200克。

火龙果的根系主要分布在表土层，所以施肥应采用撒施法，忌开沟深施，以免伤根。此外，每批幼果形成后，根外喷施0.3％硫酸镁 0.2％硼砂 0.3％磷酸二氢钾1次，以提高果实品质。由于火龙果采收期长，要重施有机质肥料，氮、磷、钾复合肥要均衡长期施用。完全使用猪、鸡粪含氮量过高的肥料，使枝条较肥厚，深绿色且很脆，大风时易折断，所结果实较大且重，品质不佳，甜度低，甚至还有酸味或咸味。因此，开花结果期间要增施钾肥、镁肥和骨粉，以促进果实糖分积累，提高品质。